数据集概述
本数据集为BioRxiv预印本相关研究数据，包含5种真菌的全基因组组装序列（.fasta格式），以及模拟群落和共生体样本的物种分类结果（.xlsx格式）。分类基于自定义数据库、NCBI RefSeq和SILVA数据库，覆盖5种引物对的扩增子测序数据，支持真菌物种分类与基因组研究。
文件详解
- 真菌基因组组装文件（.fasta格式，共5个）
- 文件名称：如Cosmosporella_olovacea_assembled.fasta、Neocucurbitaria salicis-albae_assembled.fasta等
- 内容：包含对应真菌物种的全基因组组装序列，可通过文本编辑器打开
- 物种分类结果文件（.xlsx格式，共4个）
- 文件名称：species_classification_mock.xlsx、species_classification_holobiont_SILVA.xlsx、species_classification_holobiont.xlsx等
- 内容：记录模拟群落和共生体样本的物种分类结果，基于不同数据库（自定义、NCBI RefSeq、SILVA）和引物对（7、8、9、10、3.5）的扩增子测序数据
数据来源
BioRxiv预印本（DOI: 10.1101/2024.11.25.625223 version 2）及ENA数据库（PRJEB82852）
适用场景
- 真菌基因组研究：分析5种目标真菌的基因组序列特征与结构
- 物种分类方法验证：对比不同数据库（自定义、NCBI RefSeq、SILVA）对真菌分类结果的影响
- 引物对性能评估：研究不同引物对（7、8、9、10、3.5）在真菌扩增子测序中的分类效率
- 共生体微生物群落分析：基于共生体样本分类结果，探究真菌与宿主的共生关系
- 生物信息数据库对比：分析自定义数据库、NCBI RefSeq与SILVA在真菌物种分类中的应用差异
