数据集概述
本数据集围绕β冠状病毒刺突蛋白S1/S2弗林蛋白酶切割位点域展开,包含序列数据、结构域分析结果及功能位点预测输出,为研究该区域的多功能性特征提供基础数据支持。
文件详解
- betacov_matching_IPR042578.fasta:FASTA格式,2022年12月4日从InterPro获取的2465条β冠状病毒刺突蛋白同源超家族重叠序列
- betacov_matching_IPR042578_motif.fasta:FASTA格式,基于Data File 1用FindFur算法提取的98122条20氨基酸长度弗林蛋白酶切割位点基序序列
- table_s1s2_hits_betacov_polyf.pdf:PDF格式,β冠状病毒S1/S2域序列匹配汇总表,含pat7核定位信号(-)、O-糖基化位点(*)、弗林蛋白酶切割位点(^)标注
- table_s1s2_hits_betacov_polyf.xlsx:Excel格式,与PDF表内容一致的结构化数据文件
- betacov_s1s2_nls_pat7_furin_psort.txt:TXT格式,5条代表性β冠状病毒刺突序列域的核定位信号预测结果,含SARS-CoV-2和MERS-MA30 CoV的pat7阳性结果
- betacov_s1s2_oglyc_netogly.txt:TXT格式,5条代表性β冠状病毒刺突序列域的Thr/Ser O-糖基化位点预测结果(NetOGlyc4.0评分>0.5为阳性)
- betacov_s1s2_nls_pat7_furin_blastp.txt:TXT格式,β冠状病毒刺突序列域的BLASTp搜索输出,含搜索参数及结果
适用场景
- β冠状病毒分子结构研究:分析刺突蛋白S1/S2域的序列特征与功能位点分布
- 病毒功能机制研究:探究弗林蛋白酶切割位点、核定位信号及糖基化位点的生物学功能
- 病毒进化分析:对比不同β冠状病毒刺突蛋白关键结构域的序列保守性与差异性
- 抗病毒靶点筛选:为针对S1/S2切割位点的药物或疫苗研发提供数据参考