数据集概述
本数据集为研究真菌模拟群落ITS2区域嵌合序列形成的DNA metabarcoding分析数据,通过不同复杂度的真菌模拟群落,探究PCR扩增和454测序过程中嵌合序列的形成率,评估Perseus和UCHIME两种算法的嵌合检测能力,分析嵌合形成的相关因素,包含1个压缩文件。
文件详解
- 文件名称:Aas et al 2016.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件包含真菌模拟群落ITS2区域DNA metabarcoding分析相关数据,具体字段未提供预览,推测涵盖ITS2序列读取数据、嵌合序列检测结果、模拟群落组成信息、算法评估统计数据等用于研究嵌合序列形成的原始或处理后数据。
数据来源
论文“Data from: ITS all right mama: Investigating the formation of chimeric sequences in the ITS2 region by DNA metabarcoding analyses of fungal mock communities of different complexities”
适用场景
- 真菌群落metabarcoding方法优化: 分析ITS2区域嵌合序列形成率及影响因素,优化PCR扩增和测序流程以减少嵌合偏差。
- 嵌合检测算法性能评估: 基于真菌模拟群落数据,验证Perseus和UCHIME等算法在ITS区域的嵌合检测准确性。
- 微生物生态数据分析: 研究群落复杂度对嵌合序列形成的影响,为自然真菌群落metabarcoding数据的嵌合校正提供参考。
- 分子生物学技术研究: 分析GC含量等序列特征与嵌合断点的关联,探究嵌合序列形成的分子机制。