数据集概述
本数据集包含甲藻Abedinium的单细胞转录组学研究相关补充文件,涵盖两个物种(A. dasypus和新种A. folium)的转录组序列、系统发育分析比对文件、补充视频及电子表格,用于支撑其作为新早期分支甲藻谱系的研究结论,涉及转录组特征、质体功能及线粒体基因组等分析内容。
文件详解
- 转录组序列文件
- 文件名称:Abedinium_folium_DICHO17_03_rnaspades.fasta、Abedinium_dasypus_DSEL18_54_rnaspades.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含两个Abedinium物种的转录组组装序列,用于基因注释和系统发育分析。
- 补充视频文件
- 文件名称:supplementary_video3_DICH17_03.MP4、supplementary_video2_DSEL18_59.mp4、supplementary_video1_DSEL18_54.MP4
- 文件格式:MP4
- 字段映射介绍:记录Abedinium细胞的显微观察视频,用于物种形态学鉴定与文档记录。
- 补充电子表格
- 文件名称:supplementary_spreadsheet.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含研究相关的补充数据表格,具体内容未提供预览。
- 比对文件压缩包
- 文件名称:supplementary_alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为系统发育分析所用的序列比对文件,用于支撑Abedinium谱系进化关系的结论。
适用场景
- 甲藻进化谱系研究: 利用转录组序列分析Abedinium作为新早期分支甲藻谱系的分类地位。
- 单细胞转录组特征分析: 探究Abedinium的基因表达、质体功能及线粒体基因组特征。
- 物种形态学辅助鉴定: 通过补充视频观察Abedinium细胞形态,辅助新物种A. folium的分类描述。
- 分子系统发育分析: 基于比对文件开展甲藻大类群的系统发育关系重建与验证。