数据集概述
本数据集聚焦东北亚冷杉复合体(ANSC)的遗传结构研究,包含728个个体的核基因组、线粒体及叶绿体基因组数据,以及种群结构、主成分分析、物种分布模型等结果文件,揭示其沿东北亚环状地形的遗传连接与网状进化模式。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据内容与文件结构描述
- 核基因组数据文件
- 文件名称:Dataset_S1__P38r5SNP.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:38个种群507个核单核苷酸多态性(SNP)数据
- 种群主成分分析文件
- 文件名称:Dataset_S8_popn_PCA.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:种群水平主成分分析结果数据
- 个体主成分分析文件
- 文件名称:Dataset_S7_indiv_PCA.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:个体水平主成分分析结果数据
- 结构分析文件
- 文件名称:Dataset_S6__StructureQ_MT_CP.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:线粒体与叶绿体基因组的Structure Q值数据
- 迁移分析文件
- 文件名称:Dataset_S5_MigSeqOutput.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:迁移分析输出结果数据
- 物种分布模型文件
- 文件名称:Dataset_S4_ENM_rawGISDatapoints-2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:物种分布模型原始GIS数据点
- 线粒体基因组文件
- 文件名称:Dataset_S3_mt728.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:728个个体的线粒体基因组序列数据
- 叶绿体基因组文件
- 文件名称:Dataset_S2_cp728.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:728个个体的叶绿体基因组序列数据
- 视频文件
- 文件名称:Movie_S2_Popn_GD_3PCA.mp4、Movie_S1_indiv_GD_3PCA.mp4
- 文件格式:MP4
- 字段映射介绍:种群及个体水平三维主成分分析视频结果
数据来源
论文“Circular genetic structure of the Abies nephrolepis species complex shaped by the circular landform of Northeast Asia”
适用场景
- 植物遗传结构分析: 研究冷杉复合体的核基因组、线粒体及叶绿体基因组遗传多样性与种群结构
- 生物地理学研究: 分析东北亚环状地形对冷杉复合体遗传连接的影响
- 进化生物学研究: 探讨冷杉复合体的网状进化模式与物种形成机制
- 物种分布模型构建: 基于GIS数据点模拟冷杉复合体的潜在分布区
- 迁移模式分析: 解析冷杉复合体的基因流方向与强度变化规律