数据集概述
本数据集提供基于13C NMR光谱数据的天然产物结构去重复研究结果,包含从生物磁共振库(BMRB)代谢组学部分选取的58组碳-13 NMR数据集的结构搜索结果,涉及ascochitine的JSON文件修正、按Schymanski和Bolton标准的CSV文件补充及部分化合物的PNG结构图优化,共4个文件。
文件详解
- JSON.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含ascochitine的JSON文件,已完成数据修正,内容涉及化合物结构相关的JSON格式数据
- PNG.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含优化后的化合物PNG结构图,涉及化合物28、38、46、57、7、26的分子结构可视化文件
- structures.sdf
- 文件格式:SDF
- 字段映射介绍:包含所选化合物的结构数据文件,存储天然产物的化学结构信息
- compounds.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含化合物信息表格,字段有Name(名称)、SMILES(简化分子线性输入规范)、InChIKey(国际化合物标识密钥)、PubChem_CID(PubChem化合物ID)、Synonym(同义词)、CAS_RN(CAS登记号)、Comment(注释)
数据来源
论文“An assessment of acd_lotus for the structural dereplication of natural products using 13C NMR spectroscopy data”
适用场景
- 天然产物结构解析: 利用13C NMR数据和acd_lotus数据库进行天然产物的结构去重复与鉴定
- 代谢组学研究: 分析BMRB代谢组学数据集中化合物的结构特征与分类
- 药物研发: 辅助天然产物来源药物的结构验证与筛选
- 化学数据库构建: 为建立化学结构与光谱数据关联的专业数据库提供参考案例