数据集概述
本数据集通过单细胞RNA测序技术，解析对乙酰氨基酚过量后早期肝细胞亚群的分子响应事件，利用标志性基因将肝细胞沿门-中央静脉轴进行空间定位，消除该梯度上先天的基因表达差异。数据集包含13个文件，提供关键亚群间差异表达基因列表及基因空间分区分类（中央周围、门周或非分区）。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README.txt、Additional_File_1.docx、Additional_File_4.docx
- 文件格式：TXT、DOCX
- 字段映射介绍：README.txt说明数据基本信息；Additional_File_1.docx记录对照组与APAP组中肝细胞、内皮细胞及库普弗细胞数量；Additional_File_4.docx为方法细节补充文档
- 压缩文件
- 文件名称：Additional_File_12.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩存储的补充数据文件
- 表格类文件
- 文件名称：Additional_File_3.csv、Additional_File_11.csv、Additional_File_2.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Gene（基因）、MSE（均方误差）、Slope（斜率）、Std.Error（标准误差）、pvalue（P值）、FDR.adjusted.pvalue（校正后FDR值）、ZonationAxis（分区轴）等字段，记录基因空间分区相关统计数据
- 表格类文件
- 文件名称：Additional_File_7.xlsx、Additional_File_8.xlsx、Additional_File_10.xlsx、Additional_File_6.xlsx、Additional_File_9.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：提供差异表达基因列表及基因空间分区（中央周围、门周或非分区）分类结果
数据来源
论文“Spatial reconstruction of the early hepatic transcriptomic landscape after an acetaminophen overdose using single-cell RNA sequencing”（DOI: 10.1093/toxsci/kfab052）
适用场景
- 肝脏毒理学研究: 分析对乙酰氨基酚过量后早期肝脏细胞的分子响应机制及毒性损伤路径
- 肝细胞亚群功能解析: 研究不同空间位置肝细胞亚群的基因表达特征与功能差异
- 基因空间分区机制研究: 基于基因分区分类数据，探究肝脏门-中央静脉轴的基因表达梯度规律
- 差异表达基因功能分析: 利用差异表达基因列表，挖掘对乙酰氨基酚响应的关键调控基因与通路
- 肝脏转录组空间建模: 结合单细胞数据与空间定位信息，构建肝脏转录组空间景观模型
