数据集概述
本数据集为硬珊瑚Acropora samoensis同域种群异步产卵相关的遗传分析数据，包含13个微卫星位点、线粒体控制区及两个核内含子的多基因座遗传比较结果，用于评估春季和秋季产卵群体的生殖隔离水平与遗传分化，揭示隐存物种及古老遗传谱系。
文件详解
- 微卫星数据集文件
- 文件名称：Microsatellite dataset.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Colony ID（群体ID）、Transect（样带）、Latitude（纬度）、Longitude（经度）、Date sampled（采样日期）、Spawn cohort（产卵群体）及13个微卫星位点（如EST245、WGS153等）的基因型数据
- 序列比对文件（共4个）
- 文件名称：mtDNA_CR_alignment.nexus、Calmodulin_alignnment.nexus、PaxC_cds_alignment.nexus、PaxC_intron_alignment(2).nexus
- 文件格式：NEXUS
- 字段映射介绍：分别为线粒体控制区、钙调蛋白、PaxC编码区、PaxC内含子的序列比对数据
- 说明文档
- 文件名称：README_for_Microsatellite dataset.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：微卫星数据集的说明文档，包含数据背景、文件内容及联系方式
- 基因库登录号文件
- 文件名称：S4-WAM_GenBank_Accession_No.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含研究相关序列的GenBank登录号信息
数据来源
论文“Asynchronous spawning in sympatric populations of a hard coral reveals cryptic species and ancient genetic lineages”
适用场景
- 珊瑚生殖隔离研究：分析同域种群异步产卵对基因流的阻碍作用
- 隐存物种鉴定：通过遗传分化数据识别硬珊瑚中的隐存物种
- 珊瑚进化谱系分析：利用多基因座数据追溯珊瑚古老遗传谱系的演化历史
- 珊瑚适应性进化研究：探究PaxC等基因在珊瑚产卵时间分化中的选择作用
- 海洋生物多样性保护：为珊瑚物种多样性评估及保护策略制定提供遗传依据
