数据集概述
本数据集包含大堡礁鹿角珊瑚(Acropora millepora)的种群遗传结构研究数据,基于11个微卫星位点对20个采样点的947个珊瑚群体进行基因分型,覆盖大堡礁近全长区域,用于分析历史与当代因素对珊瑚种群遗传分化的影响,包括区域遗传差异、基因交流模式及扰动事件对遗传多样性的影响。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_van Oppen et al. 2011 Acropora millepora microsatellite data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据为大堡礁鹿角珊瑚微卫星数据,包含11个位点、20个种群,已移除重复多位点基因型;数据行依次为样本ID、采集地点、各微卫星位点的等位基因(每个位点占两列,如C和D列为Am2_002位点的两个等位基因)
- 微卫星数据文件
- 文件名称:van Oppen et al. 2011 Acropora millepora microsatellite data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:表格结构包含样本ID(A列)、采集地点(B列)、11个微卫星位点的等位基因数据(C-X列,每个位点的两个等位基因占连续两列,列首标注位点名称)
数据来源
论文“Historical and contemporary factors shape the population genetic structure of the broadcast spawning coral, Acropora millepora, on the Great Barrier Reef”
适用场景
- 珊瑚种群遗传结构分析: 研究大堡礁鹿角珊瑚的区域遗传分化模式、基因流强度及种群连通性
- 珊瑚礁保护与管理: 基于种群遗传数据识别优先保护单元,制定针对性的珊瑚礁保护策略
- 环境扰动对珊瑚遗传多样性影响研究: 分析珊瑚白化等扰动事件对种群遗传多样性的潜在影响
- 珊瑚礁生物地理学研究: 结合历史气候数据探讨冰期避难所对当代珊瑚种群遗传结构的塑造作用