数据集概述
本数据集包含Acropyga属蚂蚁的系统发育基因组学研究数据，通过944个超保守元件（UCEs）位点，对23个物种的41个代表样本进行系统发育重建，同时开展生物地理学历史、分化时间估算及共生关系演化分析，为该属蚂蚁与粉蚧共生关系的协同进化研究提供基础框架。
文件详解
- BEAST_Acropyga_UCE-100.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST分析的配置文件，包含用于分化时间估算的参数设置、模型选择及数据关联信息
- RAxML_Besttree_Acropyga_UCE-944.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：基于944个UCE位点通过RAxML分析得到的最优系统发育树文件，记录物种间的亲缘关系拓扑结构
- RAxML_Acropyga_UCE-944.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：用于RAxML系统发育分析的输入数据文件，包含944个UCE位点的序列信息及分析参数
- BEAST_Acropyga_UCE-100.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：用于BEAST分化时间分析的输入数据文件，包含100个UCE位点的序列信息及模型设置
- BEAST_Acropyga_UCE-100.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：通过BEAST分析得到的带分化时间估算的系统发育树文件，记录物种分化节点的时间信息
数据来源
论文“Phylogenomics, biogeography and diversification of obligate mealybug-tending ants in the genus Acropyga”
适用场景
- 蚁科昆虫系统发育研究: 利用UCE位点数据重建Acropyga属蚂蚁的物种亲缘关系，分析类群演化历史
- 生物地理学分析: 通过分化时间估算和祖先分布区重建，探究Acropyga属蚂蚁的地理起源及扩散路径
- 共生关系演化研究: 结合系统发育树开展祖先状态重建，分析蚂蚁与粉蚧共生关系的演化模式
- 分子进化模型验证: 对比不同系统发育分析方法（串联法、物种树法）的结果，评估UCE位点在蚁科系统发育研究中的适用性
- 物种分化机制探讨: 关联生物地理历史与共生关系演化，分析Acropyga属蚂蚁多样化的驱动因素
