数据集概述
本数据集包含AdapterRemoval v2.2.1程序在不同样本集、不同计算环境下运行时的参数设置表格。核心参数为--minquality(最小质量值)和--minadapteroverlap(最小接头重叠长度),数据以单一表格文件呈现,可用于参考生物信息序列数据预处理的参数配置差异。
文件详解
- 文件名称:adapter-removal-read-trimming-settings-v01.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:表格记录了针对不同样本集、不同计算环境的AdapterRemoval v2.2.1程序参数设置,核心字段包括样本集标识、计算环境信息、--minquality参数值、--minadapteroverlap参数值等(具体字段以表格实际列为准)。
适用场景
- 生物信息序列预处理参数优化: 参考不同样本集的--minquality和--minadapteroverlap参数设置,优化序列数据接头去除与质量过滤流程。
- 计算环境参数适配研究: 分析不同计算环境下参数设置的差异,为跨平台运行AdapterRemoval程序提供配置参考。
- 生物信息工具参数标准化: 整理AdapterRemoval v2.2.1的参数使用案例,支撑序列预处理流程的标准化建设。
- 测序数据质量控制分析: 结合参数设置与数据处理结果,评估不同参数对序列数据质量的影响。