数据集概述
本数据集基于Affymetrix犬类SNP基因分型芯片,对北美犬科动物混合区的44只犬科动物(含近期扩张的郊狼及其与狼的杂交种群)进行基因渗入分析,识别出60个差异渗入的基因组区域,涉及影响体型和骨骼比例的基因,揭示狼源等位基因向美国南部郊狼种群的渗透情况,用于研究基因渗入的进化效应。
文件详解
- Sample_Information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含44只北美犬科动物的样本基本信息,支撑基因渗入分析的样本背景查询
- AIMS_delta.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于3102个祖先信息标记(AIMS)的分析结果,记录差异渗入基因组区域的相关数据,包括外源祖先比例及delta值等核心指标
适用场景
- 进化基因组学研究:分析犬科动物混合区基因渗入的模式、方向及对基因组背景的影响
- 表型-基因型关联分析:探究渗入区域中影响体型等表型特征的关键基因功能
- 物种适应性进化研究:评估渗入等位基因在新环境中的适应价值及选择压力
- 生物地理扩张机制研究:解析郊狼扩张过程中与狼的杂交对其基因组和表型转变的作用
- 基因流动历史重建:推断美国南部郊狼种群中狼源等位基因的起源(种内基因流或古代杂交)