数据集概述
本数据集为墨西哥城两个样本的血脂性状混合映射研究结果,包含染色体11上BUD13/ZNF259/APOA5区域的基因座祖先与甘油三酯水平的关联分析数据,以及精细定位结果指向rs964184为关联信号主要驱动变异的相关信息,共9个文件。
文件详解
- 主结果文件
- 文件名称:Mexico-City-AM-signals.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含墨西哥城样本混合映射研究的核心信号数据,涉及染色体11区域基因座祖先与甘油三酯水平的关联结果及精细定位信息
- 样本1血脂性状混合映射结果文件(共4个)
- 文件名称:MC-sample1-HDL-AM.out、MC-sample1-LDL-AM.out、MC-sample1-TCHOL-AM.out、MC-sample1-TG-AM.out
- 文件格式:OUT
- 字段映射介绍:分别对应样本1的高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)、总胆固醇(TCHOL)、甘油三酯(TG)性状的混合映射分析结果
- 样本2血脂性状混合映射结果文件(共4个)
- 文件名称:MC-sample2-HDL-AM.out、MC-sample2-LDL-AM.out、MC-sample2-TCHOL-AM.out、MC-sample2-TG-AM.out
- 文件格式:OUT
- 字段映射介绍:分别对应样本2的高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)、总胆固醇(TCHOL)、甘油三酯(TG)性状的混合映射分析结果
数据来源
论文“Admixture mapping in two Mexican samples identifies significant associations of locus ancestry with triglyceride levels in the BUD13/ZNF259/APOA5 region and fine mapping points to rs964184 as the main driver of the association signal”
适用场景
- 血脂代谢遗传机制研究:分析染色体11区域基因座祖先与甘油三酯等血脂性状的关联,探究rs964184变异的致病机制
- 人群遗传差异分析:比较墨西哥原住民与欧洲人群中rs964184-G等位基因频率差异,研究遗传背景对血脂性状的影响
- 基因组学混合映射方法验证:基于墨西哥城样本数据,验证混合映射技术在复杂疾病性状关联分析中的应用效果
- 心血管疾病风险标记物筛选:通过血脂性状关联位点分析,筛选潜在的心血管疾病遗传风险标记物
- 基因表达调控研究:探索rs964184变异对APOA5等基因表达及甲基化模式的调控机制