数据集概述
本数据集是论文“A linkage map of Aegilops biuncialis reveals significant genomic rearrangements compared to bread wheat”的补充数据,包含9个文件,涵盖连锁图谱、染色体关系、基因组比对等内容,支持Aegilops biuncialis与小麦等物种的基因组重排研究。
文件详解
- 连锁图谱数据文件
- 文件名称:Supplementary_Data_1_Ae.biuncialis_skeleton&global_linkage_map.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Aegilops biuncialis的骨架连锁图谱和全局连锁图谱数据
- 图表文件
- 文件名称:Supplementary_Data_2_Ae.biuncialis_skeleton_map_chart.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:Aegilops biuncialis骨架连锁图谱的图表文件
- 共线性关系文件
- 文件名称:Supplementary_Data_3_Syntenic_relationships_between_Ae.biunc,_CS_and_Ae.tauschii.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录Aegilops biuncialis、CS(中国春小麦)和Ae.tauschii之间的共线性关系
- 染色体关系文件
- 文件名称:Supplementary_Data_4_Detailed_relationships_between_individual_chromosomes.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:各染色体之间的详细关系说明
- 基因组比对CSV文件(共4个)
- 文件名称:Supplementary_Data_5_Ae.biuncialis_vs_CS_IWGSC2.1_open_in_the_Strudel_software.csv、Supplementary_Data_6_Ae.biuncialis_vs_Ae.tauschii_open_in_the_Strudel_software.csv、Supplementary_Data_7_Ae.biuncialis_vs_Ae.umbellulata_open_in_the_Strudel_software.csv、Supplementary_Data_8_Ae.biuncialis_vs_Ae.comosa_open_in_the_Strudel_software.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含feature、Biunc(Aegilops biuncialis染色体标识,如1Ub)、变异位点(如7163333|61:G>C)、Cod(编码信息)等字段,用于不同物种间的基因组比对
- FISH实验文件
- 文件名称:Supplementary_Data_9_FISH_parental_7Ub.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:Aegilops biuncialis亲本7Ub染色体的FISH(荧光原位杂交)实验相关数据
数据来源
论文“A linkage map of Aegilops biuncialis reveals significant genomic rearrangements compared to bread wheat”
适用场景
- 植物遗传学研究:分析Aegilops biuncialis的连锁图谱结构,探究其基因组特征
- 基因组重排分析:对比Aegilops biuncialis与面包小麦等物种的基因组重排差异
- 染色体关系研究:通过染色体详细关系数据,解析Aegilops biuncialis的染色体进化
- 基因组比对分析:利用CSV文件中的变异位点和共线性数据,开展跨物种基因组比对研究
- 分子标记开发:基于连锁图谱数据,开发Aegilops biuncialis的分子标记