数据集概述
本数据集包含1041份Aegilops属23个物种材料的基因分型测序（GBS）相关数据，由堪萨斯州立大学小麦遗传与资源中心（WGRC）维护。数据涵盖原始测序关联信息、过滤后的SNP矩阵、分类信息等12个文件，用于探索野生小麦近缘种Aegilops的遗传特征，同时对基因库材料进行分类修正与冗余筛选。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称：README.md
- 文件格式：.md
- 字段映射介绍：包含研究背景、数据内容概述及使用说明
- 条形码文件
- 文件名称：barcode.file.all.accessions.AegilopsProject.txt
- 文件格式：.txt
- 字段映射介绍：包含Flowcell Lane（测序通道）、Barcode（条形码）、FullSampleName（样本全名）、Biological_rep（生物学重复）、Sequence_File（测序文件）、Sequence_File_NCBI_BioProject#（NCBI生物项目编号）等字段
- 压缩文件（共9个）
- 文件名称示例：gene.bank.curation.tauschii_F_MAF0.05_Miss50_Het10-tauschii.genome-tags.fastq-all.vcf.hmp.txt.zip、filtered.numeric.coded.SNP.matrix.hmp.txt.zip等
- 文件格式：.zip
- 字段映射介绍：包含不同物种（如tauschii、searsii）、不同过滤条件（如MAF0.05、Miss50、Het10）的SNP矩阵、基因分型标签数据等，解压后为文本格式的基因数据文件
数据来源
Wheat Genetics and Resource Center (WGRC) at Kansas State University、NCBI SRA（BioProject #PRJNA985892）、Dryad repository
适用场景
- 植物遗传学研究：分析Aegilops属不同物种的基因组特征与遗传多样性
- 基因库管理优化：通过冗余材料识别与分类修正，完善野生小麦近缘种基因库资源
- 小麦亲缘关系分析：探索小麦与Aegilops属各物种间的基因组关联
- 分子标记开发：利用SNP矩阵数据开发Aegilops属物种的分子标记工具
- 作物遗传改良：为小麦抗逆、品质等性状改良提供野生近缘种的遗传资源参考
