数据集概述
本数据集围绕叶甲Agelasa nigriceps的系统地理结构及宿主范围进化展开，包含线粒体DNA序列、AFLP数据及相关系统发育分析文件，用于探究该叶甲宿主适应性进化机制，支持昆虫-植物互作下的物种分化研究。
文件详解
- 文件名称：AFLP_data.txt，格式：TXT
- 字段映射介绍：包含AFLP分子标记数据，记录样本的片段长度等遗传信息，如AC-CTA_400.16等标记条目
- 文件名称：AFLP_NJ_tree.nwk，格式：NWK
- 内容说明：基于AFLP数据构建的邻接（NJ）系统发育树文件
- 文件名称：COI_Bayesian_consensus_tree.tre，格式：TRE
- 内容说明：基于COI基因序列的贝叶斯共识系统发育树文件
- 文件名称：BEAST_input.zip，格式：ZIP
- 内容说明：BEAST软件分析所需的输入文件压缩包
- 文件名称：COI_alignment.fas，格式：FAS
- 内容说明：线粒体COI基因序列的比对文件
- 文件名称：MrBayes_input.nex，格式：NEX
- 内容说明：MrBayes软件分析所需的输入文件
数据来源
论文“Deep phylogeographic structure and parallel host range evolution in the leaf beetle Agelasa nigriceps”
适用场景
- 昆虫系统地理学研究：分析叶甲Agelasa nigriceps的种群遗传结构与地理分化模式
- 宿主适应性进化分析：探究该叶甲对不同宿主植物（如Actinidia arguta和Pterostyrax hispidus）的适应性进化机制
- 分子系统发育构建：利用线粒体COI序列和AFLP数据构建系统发育树，解析物种进化关系
- 物种分化机制研究：结合地理分布与宿主利用数据，揭示昆虫-植物互作驱动的物种分化过程
- 进化生物学软件应用：作为BEAST、MrBayes等系统发育分析软件的输入案例，支持方法学验证与教学
