数据集概述
本数据集为地中海港口鱼类环境DNA(eDNA)宏条形码检测数据,2018年和2019年在多个地中海港口采集表层水样(2018年为2升单重复,2019年为1升四重复),通过12S rRNA和线粒体COI基因标记生成数据。包含各采样周期及标记对应的生物信息学分析后ASV/MOTUs表、 curated注释表,以及OTU存在-缺失表,共一个文件。
文件详解
- 文件名称:DATASETs Aglieri et al. 2023.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含多组工作表,核心内容分类如下:
- 2018年采样周期(12S rRNA/COI标记):生物信息学流程后ASV/MOTUs表、curated物种注释表
- 2019年采样周期(12S rRNA/COI标记):生物信息学流程后ASV/MOTUs表、curated物种注释表
- OTU存在-缺失表:记录各样本中OTU的有无信息
适用场景
- 地中海港口渔业活动监测:通过鱼类eDNA检测结果关联港口渔业船队活动模式
- 非本地物种传播研究:分析eDNA数据识别地中海港口非土著鱼类物种及其扩散趋势
- 海洋生物多样性评估:基于12S rRNA和COI标记的eDNA数据,评估港口鱼类群落组成
- 环境DNA宏条形码技术应用:验证eDNA技术在港口水生生物监测中的有效性与准确性