数据集概述
本数据集为Venkataraman等人关于埃及伊蚊干旱繁殖适应性基因研究的补充数据,包含论文原始数据、补充分析数据及血液喂养装置操作说明。数据覆盖蛋白质组学、转录组学、基因序列比对、气候分析等多维度内容,支持研究干旱环境下埃及伊蚊繁殖相关基因的功能与进化机制。
文件详解
该数据集包含39个文件,主要类型及示例如下:
- 说明文档(README):
- README_for_SupplementaryDataFiles.xlsx、README_for_SupplementaryDataFiles_v2.xlsx、README_for_SupplementaryDataFiles_v3.xlsx: Excel格式,提供各版本补充数据文件的说明
- 原始与分析数据文件(.xlsx格式):
- SupplementaryDataFile01-RawData_Figure1.xlsx: 图1原始数据
- SupplementaryDataFile02-OvaryBulkRNAseq_TranscriptsPerMillion_AllSamples.xlsx: 卵巢转录组数据(每百万转录本数)
- SupplementaryDataFile04-HemolymphProteomics_log2_t-tests_median_normalized.xlsx: 血淋巴蛋白质组学归一化数据及t检验结果
- 基因与蛋白质序列文件:
- SupplementaryDataFile05-WholeLocusProteinSequences_Aedes_Culex_Anopheles.fasta: 埃及伊蚊、库蚊、按蚊全基因座蛋白质序列(FASTA格式)
- SupplementaryDataFile06-MultipleSequenceAlignments_PercentIdentityMatrices.clw: 多序列比对及一致性矩阵(CLW格式)
- 气候分析与统计脚本(.r、.sh格式):
- SupplementaryDataFile17-ClimateAnalysis.r: 气候分析R脚本
- SupplementaryDataFile19-raincloudplots.r: 雨云图绘制R脚本
- SupplementaryDataFile20-permutationscript.sh: 置换检验Shell脚本
- 实验装置相关文件:
- SupplementaryDataFile15-MetalBloodPuck_BenchManual.pdf: 金属血液喂养装置操作手册
- SupplementaryDataFile12-MetalBloodPuckFabrication_2D_3D_Drawings.pdf: 装置加工图纸
- SupplementaryDataFile14-MetalBloodPuck_3DModel.stp: 装置3D模型(STP格式)
适用场景
- 分子生物学研究: 分析埃及伊蚊干旱适应相关基因与蛋白质的序列特征及表达模式
- 昆虫生理学研究: 探究干旱环境下埃及伊蚊血淋巴蛋白质组变化及卵巢转录组响应机制
- 气候适应性研究: 结合气候数据与昆虫生理数据,研究环境因素对埃及伊蚊繁殖能力的影响
- 实验方法学参考: 基于金属血液喂养装置的设计与操作手册,优化蚊虫实验室饲养技术
- 生物信息学分析: 利用基因序列比对数据与统计脚本,复现或扩展基因进化与功能分析