数据集概述
本数据集为荧光显微镜图像基准数据集,含Hoechst 33342染色的细胞核、核碎片及微核标注。图像来自U2OS骨肉瘤细胞系RNA干扰筛选,共50张图像、2000余个标注核对象,预分为训练、开发、测试集,可用于训练细胞核分割神经网络。
文件详解
该数据集包含5个文件,具体说明如下:
- 数据文件(压缩包形式):
- training_nuclei.zip:训练集压缩包,格式为ZIP,含训练用荧光显微镜图像及标注
- development_nuclei.zip:开发集压缩包,格式为ZIP,含开发用荧光显微镜图像及标注
- test_nuclei.zip:测试集压缩包,格式为ZIP,含测试用荧光显微镜图像及标注
- 工具与说明文件:
- C01_to_png.py:Python脚本文件,用于将C01格式图像转换为PNG格式
- readme.md:Markdown文档,含C01格式转TIFF/PNG格式的操作说明
适用场景
- 生物医学图像处理:训练与评估细胞核实例分割或语义分割的神经网络模型
- 细胞生物学研究:分析RNA干扰筛选中细胞核形态变化与核碎片、微核形成的关联
- 医学影像算法开发:测试荧光显微镜图像自动标注算法的准确性与鲁棒性
- 高通量成像分析:构建基于深度学习的细胞表型自动化分析流程