数据集概述
本数据集包含木兰属两种物种(星花木兰与柳叶木兰)及其杂交种的基因数据,通过贝叶斯基因扩散模型分析杂交带内物种间的兼容性。数据涵盖307株成年植株和574粒种子的微卫星标记基因型、叶绿体SSR单倍型等信息,用于研究种间交配的不兼容性及杂交后代的产生机制。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_Data_and_script_for_AJB_IT170914.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集结构,包括原始数据的编码规则(nSSR基因型为片段大小、cpSSR单倍型为大写字母、缺失数据为“NA”)及子文件目录说明。
- 压缩数据包
- 文件名称:Data_and_script_for_AJB_IT170914.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含原始数据目录original_data,其中adult27loci170113.txt记录307株成年植株的27个nSSR基因型和cpSSR单倍型数据,含ID、样本类型等字段;另含种子相关基因数据(具体字段未完全列出)。
数据来源
论文“Reduced incompatibility in the production of second generation hybrids between two Magnolia species revealed by Bayesian gene dispersal modeling”
适用场景
- 植物杂交兼容性研究: 分析木兰属物种间及杂交种的交配不兼容性,评估F1及回交后代的产生机制。
- 基因扩散模型验证: 利用贝叶斯模型数据验证植物种群基因流动与杂交带动态的关系。
- 植物遗传学数据分析: 通过nSSR和cpSSR标记数据,研究木兰属物种的遗传多样性与遗传结构。
- 杂交后代适应性评估: 结合成年植株与种子的基因数据,分析杂交后代在自然环境中的存活优势与选择压力。