数据集概述
本数据集围绕阿拉斯加驼鹿(Alces alces)种群遗传结构展开,分析安克雷奇城区与基奈半岛驼鹿种群的遗传分化是否与人为交通设施(如高速公路及围栏)相关。通过微卫星数据评估栖息地连通性变化对种群空间遗传结构的影响,包含遗传数据、空间坐标及分析输入文件,共5个文件。
文件详解
- README_for_sPCA infiles.txt:TXT格式,说明sPCA分析(空间主成分分析)的输入文件信息,对应R包adegenet的分析需求
- README_for_Geneland infiles.txt:TXT格式,说明Geneland分析的输入文件信息
- Geneland infiles.zip:ZIP格式,Geneland分析所需的输入文件压缩包
- Genotypic_data_and_spatial_coordinates_Alaska_Moose.xlsx:XLSX格式,包含阿拉斯加驼鹿的基因型数据及空间坐标信息
- sPCA infiles.zipx:ZIPX格式,sPCA分析所需的输入文件压缩包(含微卫星基因数据文件、空间坐标文件)
数据来源
论文“A genetic discontinuity in moose (Alces alces) in Alaska corresponds with fenced transportation infrastructure”
适用场景
- 野生动物遗传学研究:分析驼鹿种群的遗传分化及空间遗传结构特征
- 栖息地连通性评估:探究人为交通设施对野生动物栖息地连通性及基因流的影响
- 保护生物学应用:为野生动物保护策略制定提供遗传层面的数据支持
- 空间遗传学分析:作为sPCA、Geneland等空间遗传分析方法的案例数据,支持相关分析流程验证