数据集概述
本数据集围绕链格孢菌（Alternaria alternata）中bZIP转录因子展开，包含该真菌的基因组序列、基因注释及代谢通路分析文件，覆盖基因功能、KEGG通路、GO注释等信息，为研究其在胁迫响应与致病过程中的作用提供基础数据支撑。
文件详解
- 基因组序列文件
- Alternaria_alternata_Z7_complete.fna：FNA格式，链格孢菌完整基因组序列
- Alternaria_alternata_Z7_v1.0.fna：FNA格式，链格孢菌基因组v1.0版本序列
- Alternaria_alternata_Z7.CDS.fna：FNA格式，链格孢菌编码序列（CDS）
- Alternaria_alternata_Z7_v1.0.ffn：FFN格式，链格孢菌核苷酸序列（包含CDS及其他功能区域）
- 蛋白质序列文件
- Alternaria_alternata_Z7.faa：FAA格式，链格孢菌蛋白质序列
- 基因结构注释文件
- Alternaria_alternata_Z7.gff3：GFF3格式，链格孢菌基因结构注释信息
- 功能注释文件
- Alternaria_alternata_Z7_NCBI_NR_ANNOTATION.xlsx：XLSX格式，基于NCBI NR数据库的基因注释
- Alternaria_alternata_Z7_Gene_Ontology(GO)_ANNOTATION.xlsx：XLSX格式，基因本体（GO）注释
- Alternaria_alternata_Z7_KEGG_ANNOTATION_by_ko.xlsx：XLSX格式，基于KO编号的KEGG通路注释
- Alternaria_alternata_Z7_KEGG_ANNOTATION_by_aalt00001.xlsx：XLSX格式，基于aalt00001通路的KEGG注释
- aalt00001.keg：KEG格式，链格孢菌特定代谢通路（aalt00001）注释
适用场景
- 真菌基因功能研究：分析链格孢菌bZIP转录因子的结构与功能特征
- 胁迫响应机制分析：结合注释数据探究转录因子在环境胁迫下的调控通路
- 致病机制研究：挖掘bZIP转录因子在链格孢菌侵染宿主过程中的作用靶点
- 代谢通路分析：利用KEGG注释数据解析真菌代谢网络与胁迫/致病的关联
- 基因组学基础研究：为链格孢菌分子生物学实验提供基因组与基因注释参考
