数据集概述
本数据集聚焦中美洲慈鲷科Amatitlania属的系统地理学模式与物种界定研究，包含318个个体的线粒体DNA序列分析结果，涉及该属全部3个已识别物种的地理分布范围。数据支持将Amatitlania属划分为2个独立物种，并揭示其更新世以来的演化历史，共包含23个相关文件。
文件详解
- 系统发育分析文件
- 文件名称示例：An_CB_408wouts_forGARLI.NEX、RPS7_intron2_n53.NEX、full_cytb_n408.NEX
- 文件格式：NEX（NEXUS格式）
- 字段映射介绍：包含线粒体DNA序列数据（如cytb基因、RPS7内含子），用于构建系统发育树，涉及样本编号、基因序列等信息
- 贝叶斯分析文件
- 文件名称示例：Akanna_CB_5_bycodon_strict_BSP.xml、38_3spp_STAR_12v3cod_ULN_3NormCalib_PSSS100.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：包含物种界定模型、种群动态分析（如BSP贝叶斯天际线图）的参数设置与结果数据，涉及校准点、进化模型参数等
- 结果输出文件
- 文件名称示例：An_408wouts_BEAST_time_tree_newick.txt、An_RPS7_intron2_GARLI_best_newick.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含系统发育树（Newick格式）、种群扩张时间估算等分析结果，涉及节点分支长度、时间校准信息等
数据来源
论文“Phylogeography and species delimitation in convict cichlids (Cichlidae: Amatitlania): implications for taxonomy and Plio–Pleistocene evolutionary history in Central America”
适用场景
- 慈鲷科物种分类研究: 用于分析Amatitlania属的物种界定与分类修订，验证形态学分类与遗传学分类的一致性
- 中美洲淡水鱼类演化历史研究: 探究Amatitlania属在更新世以来的分化时间与种群动态，分析地理隔离对物种形成的影响
- 系统地理学模式分析: 利用线粒体DNA序列数据，研究慈鲷种群的地理分布格局与基因流模式
- 种群遗传学研究: 分析种群扩张事件（如约20万年前的种群扩张）对遗传多样性的影响，支持保护生物学中的种群管理策略制定
