数据集概述
本数据集记录了全球生物多样性热点地区一个超过200万年沙丘时间序列中，生态系统退化过程中丛枝菌根真菌（AMF）多样性的变化。通过对根和土壤样本的核糖体RNA基因测序，分析不同磷含量土壤中AMF群落组成与多样性，揭示土壤磷有效性对AMF多样性的阈值效应，包含13个相关文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：Table A1_GPSdata.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含样本的GPS地理坐标数据
- 文件名称：Table A2_PD_NRI&NTI.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含系统发育多样性（PD）、净亲缘指数（NRI）和最近分类群指数（NTI）数据
- 序列与比对文件
- 文件名称：consensus_files_AMF-OTUs.fas、Alignment_JurienBaychronosequence.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：AMF操作分类单元（OTU）的共识序列及序列比对数据
- 压缩包文件
- 文件名称：fastafiles_allroots.zip、fastafiles_allsoil.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：分别包含所有根样本和土壤样本的FASTA序列文件
- 系统发育树文件
- 文件名称：Fig1_RAxML_bipartitions_rootsamples.tre.result、Fig2_RAxML_bipartitions_soilsamples.tre.result、phylogenetictree_NTI&NRI
- 文件格式：无扩展名/RESULT
- 字段映射介绍：根样本与土壤样本的系统发育树结果及NRI、NTI相关系统发育树数据
- CSV数据文件
- 文件名称：amf2.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含样本、样地、沙丘、OTU、AMF目科属分类、序列数等AMF相关数据
- 文件名称：plantSoil.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含样本、相对丰度、覆盖度、多样性指数及土壤磷、碳、氮等理化性质数据
- 说明与中间文件
- 文件名称：README_for_Fig1_RAxML_bipartitions_rootsamples.tre.int、README_for_Fig2_RAxML_bipartitions_soilsamples.tre.int
- 文件格式：INT
- 字段映射介绍：对应系统发育树文件的说明文档
数据来源
论文“The rise and fall of arbuscular mycorrhizal fungal diversity during ecosystem retrogression”
适用场景
- 生态学研究：分析生态系统退化过程中丛枝菌根真菌多样性的变化规律
- 土壤磷循环研究：探究土壤磷有效性对真菌群落结构的影响机制
- 生物多样性保护：揭示极端磷限制环境下真菌多样性的阈值效应
- 生态系统恢复：为退化生态系统中菌根真菌群落的恢复提供数据支持
- 微生物生态学：研究根际与土壤环境中AMF群落的组成差异及驱动因素
