数据集概述
该数据集是《AMR研究中从电子表格实验室数据模板到知识图谱的FAIR数据旅程》手稿的补充数据文件,包含用于生成知识图谱的源代码及实验室数据模板所需的附加文件,支持AMR研究数据的标准化收集与FAIR化处理。
文件详解
该数据集包含一个压缩文件,具体说明如下:
- 文件名称: GNA-NOW.zip
- 文件格式: ZIP (.zip)
- 压缩包内包含内容:
- Data Survey: 用于收集项目和数据集信息,支持数据管理计划制定及实验室数据模板开发
- Lab Data Templates: Excel格式的AMR研究数据(体内、体外)收集模板,兼容grit数据仓库上传,可作为知识图谱工作流输入
- Data dictionary: 与实验室数据模板关联,确保数据录入标准化,收集模板外元数据(如菌株、化合物信息)并链接至本体
- FAIR assessments: 基于FAIR-DSM模型生成的评估报告,用于指导模板优化
适用场景
- AMR研究数据管理: 用于制定数据管理计划,标准化收集实验室数据
- 知识图谱构建: 作为AMR研究知识图谱工作流的输入数据来源
- FAIR数据实践: 支持FAIR数据标准评估与模板优化研究
- 项目数据收集: 适用于IMI2 GNA NOW等类似项目的数据收集与整理工作