数据集概述
本数据集为马达加斯加西部Anilany蛙属多样性初步评估及新种描述的研究数据,包含线粒体(16S rRNA、COI)、核基因(BDNF、RAG-1)序列、地理坐标及序列拼接文件等,用于分析该属物种的遗传变异、形态差异,支持新种Anilany karsticola的分类界定,共12个文件。
文件详解
- 基因序列文件(FASTA/FAS格式)
- 文件名称:16S5_Anilany+KMseq_Scaphiophryne.fasta、COI_Anilany+KMseq_Scaphiophryne.fasta、Anilany_RAG1.fas、Anilany_BDNF.fas等(共7个)
- 文件格式:.fasta、.fas
- 字段映射介绍:包含Anilany属及近缘类群的基因序列数据,每条序列关联样本凭证号、物种名等信息
- 基因序列文本文件(TXT格式)
- 文件名称:COI-Anilany_Taxi2.txt、16S5-Anilany_Taxi2.txt、16S3-Anilany_Taxi2.txt(共3个)
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:以表格形式记录序列ID、样本凭证号、物种、基因序列等基础信息
- 地理坐标文件
- 文件名称:Anilany_Coordinates.xlsx
- 文件格式:.xlsx
- 字段映射介绍:包含Anilany属样本采集的地理坐标信息
- 序列拼接文件
- 文件名称:Anilany_mito_concat.phy
- 文件格式:.phy
- 字段映射介绍:Anilany属线粒体基因序列的拼接数据集,用于系统发育分析
数据来源
论文“A preliminary assessment of the diversity of the frog genus Anilany (Microhylidae, Cophylinae) with description of a new species from western Madagascar”
适用场景
- 蛙类分类学研究:用于Anilany属物种的形态与遗传特征分析,支持新物种界定
- 生物多样性评估:分析马达加斯加西部Anilany蛙属的物种多样性及分布格局
- 系统发育分析:利用线粒体、核基因序列数据构建该属的亲缘关系树
- 遗传变异研究:通过基因序列差异(如16S rRNA p距离)分析种群遗传结构
- 生物地理学研究:结合地理坐标数据探讨物种分布与栖息地(如石灰岩喀斯特)的关联