数据集概述
本数据集围绕安乐蜥(Anolis)适应性辐射过程中肢体异速生长的发育模式与进化意义展开,包含15种安乐蜥胚胎期13个前后肢骨骼的生长协变数据,以及267种安乐蜥肢体骨骼的进化协变数据,用于验证适应性形态是否受生长轨迹的偏向影响。
文件详解
- 代码文件:
- 0_PrepareFinalDataset.Rmd、1_BivariateAllometry.Rmd、2_MajorAxis_Ontogeny.Rmd、3_MajorAxis_OntogenyPhylogeny.Rmd: R语言markdown代码文件,对应4个分析步骤
- functions.R: R语言辅助函数文件
- 0_PrepareFinalDataset.html、1_BivariateAllometry.html、2_MajorAxis_Ontogeny.html、3_MajorAxis_OntogenyPhylogeny.html: 代码运行生成的HTML结果文件
- 数据文件:
- Data_Embryos_Final.csv: 胚胎期肢体骨骼数据,包含个体、物种、发育阶段、13个骨骼(肱骨、尺骨、趾骨等)测量值
- Data_Adult_Individuals.csv: 成体个体肢体骨骼数据,包含个体ID、体型大小、13个骨骼测量值、物种及地理区域
- Clean_Dataset_embryos_corrQC_mod.csv: 清洗后的胚胎数据集,含生态型、岛屿等附加信息
- MuseumIndiv_DOIs.csv: 博物馆标本DOI信息
- 其他文件:
- Anolis.nex: 安乐蜥系统发育树文件
- ReadMe.txt: 数据集说明文档
适用场景
- 进化生物学研究: 分析安乐蜥适应性辐射中肢体形态的进化轨迹
- 发育生物学研究: 探究胚胎期肢体骨骼生长协变模式及其对成体形态的影响
- 进化发育生物学交叉研究: 验证发育约束与进化创新的关系
- 生物统计方法应用: 复现基于R语言的异速生长分析与系统发育比较方法