数据集概述
本数据集围绕棕安乐蜥(Anolis sagrei)性二态性的进化机制展开,包含其生长发育、基因表达及睾酮处理实验相关数据。通过父系半同胞育种设计,探究体型二态性形成过程中性别间遗传相关性的变化,以及肝脏转录组中性别偏向基因表达的动态,为理解性二态性的生理与遗传机制提供支撑。
文件详解
- 基因表达数据文件
- 文件名称:Asagrei_unique_cpm_juv.csv、Asagrei_unique_cpm_juvsub.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含安乐蜥个体(含性别、处理组信息)的基因表达量(CPM)数据,涉及Ensembl ID、不同处理组(空白、睾酮处理)及发育阶段(幼体)的样本列。
- 实验设计与样本信息文件
- 文件名称:Asagrei_RNAseq_NCBIaccessioning_20Oct2016.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录RNA-seq样本的NCBI accession信息及相关实验设计细节。
- 生长发育与表型数据文件
- 文件名称:exumdat2growth3.txt、exumdat2.txt、exumped2.txt、exumvonbertdat.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含安乐蜥个体ID、亲代信息、孵化日期、性别、月龄、体长(lnSVL)、体重(lnMass)等生长发育表型数据,覆盖不同发育阶段及性别分组。
- 数据说明文件
- 文件名称:legend.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集相关字段或样本信息的说明文档。
数据来源
论文“Hormonally mediated increases in sex-biased gene expression accompany the breakdown of between-sex genetic correlations in a sexually dimorphic lizard”
适用场景
- 爬行动物性二态性进化研究:分析性别间遗传相关性变化与性二态性形成的关联。
- 基因表达调控机制分析:探究性别偏向基因表达在生长发育过程中的动态变化及睾酮的调控作用。
- 生物遗传学实验设计参考:借鉴父系半同胞育种设计在遗传相关性研究中的应用。
- 表型与转录组数据整合分析:结合生长表型与肝脏转录组数据,解析性二态性的分子基础。