数据集概述
本数据集包含西班牙加塔角Dragoncillo Blanco峡谷182个Antirrhinum charidemi个体的基因型数据,涵盖13个微卫星位点和3个质体DNA单倍型,同时记录个体地理定位、花冠颜色、贝叶斯遗传聚类祖先得分及地理遗传亚群分配等信息,为植物群体遗传学研究提供基础数据。
文件详解
- 文件名称:
Genotype_matrix_Antirrhinum_charidemi_BDB_subpops.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含182个个体的13个微卫星位点基因型矩阵、3个质体DNA单倍型数据,以及个体地理定位信息、花冠颜色、STRUCTURE分析得到的4个基因池祖先得分、地理遗传亚群分配等元数据(元数据位于独立工作表)。
数据来源
论文“Fine-scale genetic differentiation in the bee-specialized Antirrhinum charidemi covaries more strongly with microenvironment than with corolla colour”(预计2025年发表于AoB Plants)
适用场景
- 植物群体遗传多样性研究:分析Antirrhinum charidemi群体的微卫星位点多态性及质体DNA单倍型分布特征。
- 遗传结构与地理分布关联分析:探究个体地理定位与遗传亚群、祖先得分的相关性。
- 表型与遗传关系研究:分析花冠颜色表型与基因型、遗传聚类结果的关联程度。
- 微环境对遗传分化的影响评估:结合微环境数据,验证其对群体遗传分化的驱动作用。
- 植物保护遗传学应用:为Antirrhinum charidemi的种群保护策略制定提供遗传多样性依据。