数据集概述
本数据集为氨氧化细菌（AOB）amoA基因高通量测序数据处理提供分类学参考数据库。数据库包含两个核心文件，分别提供amoA基因的分类学信息（.taxonomy格式）和基因序列模板（.fas格式），可用于环境样本中氨氧化细菌的物种鉴定和分类学分析。
文件详解
- AOB amoA-taxonomy.taxonomy
- 文件格式： TAXONOMY
- 字段映射介绍： 包含amoA基因序列对应的分类学信息，通常按分类层级（如门、纲、目、科、属、种）进行标注，用于高通量测序数据的物种分类注释。
- AOB amoA-template.fas
- 文件格式： FAS
- 字段映射介绍： 包含amoA基因的参考序列模板，采用FASTA格式存储，包含序列标识符和基因序列信息，用于序列比对和分类学分析。
适用场景
- 环境微生物群落分析: 用于土壤、水体等环境样本中氨氧化细菌的物种组成和多样性研究。
- 硝化作用过程研究: 支持氨氧化过程相关微生物的功能基因（amoA）在生态系统中的分布与丰度分析。
- 高通量测序数据注释: 作为参考数据库，对宏基因组或扩增子测序产生的amoA基因序列进行准确的分类学注释。
- 微生物生态学教学: 为微生物生态学相关课程提供氨氧化细菌分类学的教学参考数据。
