数据集概述
本数据集为澳大利亚与新几内亚彩虹鱼(Melanotaeniidae科)的系统发育与生物地理学研究数据,包含7个线粒体蛋白编码基因及核S7基因前两个内含子的测序数据(共6827个碱基对),通过系统发育分析探究该科鱼类的演化关系、生物地理历史、物种分化时间及基因渐渗事件,同时发现近20个未描述物种。数据集含3个文件。
文件详解
- 文件名称:README_for_rain.phylo.labeled.relabeled.concat.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含用于生成系统发育树的Nexus文件说明,列出各基因或密码子位置的字符集定义(如nd1=1-975、nd2=976-2021等),标注基因重叠编码区域处理方式。
- 文件名称:rain.phylo.labeled.005.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:系统发育分析相关的元数据文件,具体内容未详细说明。
- 文件名称:rain.phylo.labeled.relabeled.concat.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:用于生成系统发育树的核心数据文件,整合多基因序列数据,支持系统发育分析。
数据来源
论文“Phylogeny and biogeography of rainbowfishes (Melanotaeniidae) from Australia and New Guinea”
适用场景
- 淡水鱼类系统发育研究:分析Melanotaeniidae科鱼类的演化关系与分类地位。
- 生物地理学分析:探究澳大利亚与新几内亚彩虹鱼的地理分布格局及历史扩散路径。
- 物种分化时间估算:利用分子钟数据研究物种分化与地质事件的关联。
- 基因渐渗事件检测:识别物种间的历史基因交流事件。
- 生物多样性调查:支持未描述淡水鱼类物种的发现与分类学研究。