数据集概述
本数据集包含蒙古沙鼠内侧上橄榄(MSO)神经元在发育过程(出生后10至60天)中,躯体动作电位诱发的树突钙信号分析数据,涵盖正常声学环境与全向白噪声环境下的记录。数据支持神经生理学研究中钙信号与神经元发育关系的分析,包含成像、电生理及整合分析文件。
文件详解
- 数据文件夹(data)
- 成像文件:以.nix格式存储,每个成像神经元对应1个文件,包含感兴趣区域(ROI)提取的kymograph数据及元数据,由CaManager插件生成
- excludes.csv:记录需排除的细胞/试验(如记录错误、运动干扰、追踪困难等)
- Megatable_C.csv:包含与成像细胞对应的电生理数据
- 中间分析文件:.nix格式,用于默认参数的中间分析
- 整合数据文件:.csv格式,包含默认参数下的电生理与成像整合数据
- 单细胞数据文件:多个.xlsx格式文件,对应论文图2C、2D、2F中的单细胞数据
- 分析代码:CaJupyter GitHub仓库中的Jupyter notebook,提供分步分析指南;原始分析代码可参考CaAnalysis工具箱
数据来源
论文“Activity-Dependent Calcium Signaling in Neurons of the Medial Superior Olive during Late Postnatal Development”
适用场景
- 神经发育生理学研究:分析MSO神经元发育过程中动作电位诱发树突钙信号的变化规律
- 环境声学刺激影响研究:对比正常与白噪声环境下神经元钙信号的差异,探究声学环境对神经发育的作用
- 钙信号与电生理关联分析:结合电生理数据与成像数据,研究钙信号与神经元电活动的相关性
- 神经科学数据分析方法验证:基于Jupyter notebook复现原始分析流程,验证钙成像数据分析方法的可靠性