数据集概述
本数据集包含36匹埃及阿拉伯马（使用Equine SNP70平台基因分型）及其他血统阿拉伯马的基因型数据，用于对比系谱与基因组方法估算的近交系数、亲缘关系，验证基因组方法的优越性，同时探究近交估算所需的最小标记数量。数据支持畜牧遗传资源保护与种群多样性研究。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称：README_for_Genotypic Data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集包含的PLINK基因型文件（Study_herd.map、Study_herd.ped、Other_Arabains.ped、Other_Arabains.map）的内容，其中Study_herd.ped的第一列为家系ID、第二列为动物ID（对应论文表2），Other_Arabains.ped的第二列为阿拉伯马血统分组信息。
- 基因型数据压缩包
- 文件名称：Genotypic Data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含研究群体（Study_herd）和其他血统阿拉伯马（Other_Arabains）的PLINK格式基因型文件（.map和.ped），记录基因组SNP标记及个体基因型信息。
数据来源
论文“Application of genomic estimation methods of inbreeding and population structure in an Arabian horse herd”
适用场景
- 畜牧遗传育种研究：对比系谱与基因组方法估算的近交系数、亲缘关系，优化育种决策。
- 动物种群结构分析：通过多维缩放、聚类等方法解析阿拉伯马群体的遗传结构与血统差异。
- 遗传资源保护：利用基因组数据保护阿拉伯马等家畜的珍贵品系，监测种群基因组多样性变化。
- 分子标记优化研究：验证近交估算所需的最小SNP标记数量（如2000个连锁平衡标记），指导基因型检测方案设计。
