Arabidopsis_Capsella_Based_拟南芥与荠菜开花时间变异研究数据

数据集概述

本数据集记录了拟南芥(Arabidopsis thaliana)和荠菜(Capsella rubella)自然种群中开花时间变异的遗传学研究数据,重点关注FLOWERING LOCUS C(FLC)基因的突变影响,包含20份荠菜材料在不同条件下的开花时间观测及基因变异分析结果,共涉及4个文件。

文件详解

  • README文件
  • 文件名称:README_for_Guo_table_S4.txtREADME_for_Guo_table_S2.txt.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:分别对应表格S4和表格S2的说明文档,解释数据背景、分析方法及结果解读,其中S4的README提及SHORE v0.8和pindel v0.2.4s的分析结果及FLC基因模型标注
  • 数据表格文件
  • 文件名称:Guo_table_S2.txt.gz
  • 文件格式:GZ(压缩文本)
  • 字段映射介绍:包含荠菜材料的开花时间观测数据,可能涉及不同环境条件(春化、光周期、温度)下的开花时间记录
  • 基因变异表格文件
  • 文件名称:Guo_table_S4.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含5个工作表,Sheet1(SNPs,单核苷酸多态性)、Sheet2(short deletions,短缺失)、Sheet3(short insertions,短插入)、Sheet4(SVs,结构变异)、Sheet5(complex insertions/deletions,复杂插入缺失),记录1408号材料与参考材料MTE在FLC基因区间的变异差异

数据来源

标题为“Data from: Independent FLC mutations as causes of flowering time variation in Arabidopsis thaliana and Capsella rubella”的研究数据

适用场景

  • 植物开花时间遗传学研究: 分析拟南芥和荠菜自然种群中FLC基因突变对开花时间的影响机制
  • 植物适应性进化分析: 探究年轻物种荠菜经历遗传瓶颈后,开花时间变异的遗传基础复杂性
  • 基因功能验证: 验证FLC基因在荠菜开花调控中的作用,对比拟南芥的已知机制
  • 环境因子与开花时间关联分析: 研究春化、光周期、温度等环境条件对荠菜开花时间的调控效应
  • 植物分子标记开发: 基于S4表格的基因变异数据,开发荠菜开花时间相关的分子标记
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.58 MiB
最后更新 2026年1月13日
创建于 2026年1月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。