数据集概述
本数据集包含Arabidopsis halleri植物的基因组多样性与种群分化研究数据,对比了微卫星标记与全基因组单核苷酸多态性(SNPs)的遗传多样性及种群分化估计结果,涉及180个个体的20个微卫星标记基因分型数据与200万个SNPs的Pool-Seq数据,用于评估标记特异性偏差并为未来研究提供建议。
文件详解
- 文件名称:README_for_Aha_09_11_18_19_21_31_N1_N3_N4v3_rc.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、实验设计、分析方法及结果的详细说明,辅助理解数据内容与研究框架
- 文件名称:Aha_09_11_18_19_21_31_N1_N3_N4v3_rc
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:包含Arabidopsis halleri的遗传标记数据,可能涵盖180个个体的20个微卫星标记(12个跨物种、8个物种特异性)基因分型信息,以及Pool-Seq技术获得的全基因组SNPs多样性与种群分化相关数据
数据来源
论文“Estimating genomic diversity and population differentiation – an empirical comparison of microsatellite and SNP variation in Arabidopsis halleri”
适用场景
- 植物基因组多样性研究: 分析Arabidopsis halleri种群的遗传多样性水平及标记特异性偏差
- 种群分化评估: 对比微卫星与SNPs标记对种群分化(FST)估计结果的差异
- 分子标记选择优化: 研究不同类型分子标记(微卫星、SNPs)在遗传研究中的适用性
- 基因组学研究方法验证: 验证Pool-Seq技术在全基因组SNPs分析中的可靠性
- 植物遗传学实验设计: 为类似物种的遗传多样性研究提供标记选择与样本量设计的参考