Arabidopsis_halleri_气候候选SNP环境关联原始数据

数据集概述

本数据集为Arabidopsis halleri(十字花科植物)气候相关候选单核苷酸多态性(SNP)的环境关联研究原始数据,用于验证原研究中鉴定的适应性SNP在独立地理扩展种群中的环境关联一致性,包含444株植物的SNP数据及环境因子关联分析基础信息。

文件详解

  • 文件名称:rellstab_raw_data.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含Arabidopsis halleri植物个体的SNP基因型数据、对应种群的环境因子数据,支持开展偏Mantel检验(PMTs)和潜在因子混合模型(LFMM)等分析,用于复现候选SNP与环境因素的关联关系及等位基因-环境关系验证。

数据来源

论文“Local adaptation (mostly) remains local: reassessing environmental associations of climate-related candidate SNPs in Arabidopsis halleri”

适用场景

  • 植物适应性基因组学研究:分析候选SNP在不同地理种群中的环境关联一致性,验证适应性位点的广谱性或种群特异性。
  • 气候适应性机制验证:通过独立种群数据复现原研究的环境关联结果,探究高山异质环境下的选择压力差异。
  • 基因型-环境互作分析:研究植物适应性背后复杂的基因型与环境互作模式,评估适应性位点的普适性。
  • 景观基因组学方法比较:对比偏Mantel检验与潜在因子混合模型在环境关联分析中的应用效果与结果差异。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.23 MiB
最后更新 2026年1月22日
创建于 2026年1月22日
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