数据集概述
本数据集针对异源四倍体拟南芥(Arabidopsis kamchatica)的锌超积累特性展开研究,探讨其继承自亲本的基因表达模式。拟南芥kamchatica是锌超积累植物A. halleri与非积累植物A. lyrata的天然杂交种,保留了锌超积累能力但水平较A. halleri降低约一半。数据集包含基因表达、锌积累量及基因组重测序相关数据,共4个文件。
文件详解
- 文件名称:SupplementaryFile7.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含拟南芥kamchatica及亲本的锌积累量相关数据,如不同处理条件下的锌含量测定结果、基因表达量统计等(具体字段需参考文件内容)。
- 文件名称:SupplementaryFile5.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含基因表达分析数据,如HMA4等金属转运基因的表达量、同源基因表达比值、锌处理对基因表达的影响等(具体字段需参考文件内容)。
- 文件名称:SupplementaryFile6.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含基因组重测序相关数据,如HMA4基因座的遗传多样性分析、基因拷贝数估计等(具体字段需参考文件内容)。
- 文件名称:Akam_all.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含拟南芥kamchatica的基因组或转录组序列数据,用于基因表达分析及同源基因鉴定等。
数据来源
论文“Conserved but attenuated parental gene expression in allopolyploids: constitutive zinc hyperaccumulation in the allotetraploid Arabidopsis kamchatica”
适用场景
- 植物遗传学研究:分析异源多倍体拟南芥的基因表达模式及亲本基因的遗传规律。
- 金属超积累机制研究:探讨锌超积累相关基因(如HMA4)在拟南芥kamchatica中的表达与功能。
- 多倍体进化研究:研究异源多倍体基因组的进化历史及遗传多样性变化。
- 植物环境适应性研究:分析拟南芥kamchatica在不同金属含量土壤中的生长适应性及基因表达调控机制。
- 分子生物学实验设计:为金属转运基因功能验证、基因表达调控研究提供数据支持。