数据集概述
本数据集围绕北美Arabidopsis lyrata自交不亲和性（SI）的种内崩溃及交配系统向自交转变展开研究，验证S位点单倍型与SI丧失的关联、种群瓶颈的作用及SI丧失的突变位置。通过多种基因分型方法，结合经典遗传学与深度测序分析，揭示自交亲和性（SC）的遗传机制，为进化生物学中交配系统转变问题提供数据支持。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_for_SISCpools_consensus_chr5.docx、README_for_SISCpools_consensus_chr7.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：提供SISCpools_consensus_chr5和chr7相关数据的说明文档，包含数据背景、分析方法或结果解释等内容
- 表格文件
- 文件名称：SISCpools_consensus_chr5.xls、SISCpools_consensus_chr7.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：包含SISCpools在5号和7号染色体上的共识序列相关数据，可能涉及基因分型结果、种群遗传统计等信息
- 序列文件
- 文件名称：b160haplotypes.fa、b120haplotypes.fa、b80haplotypes.fa、B70haplotypes.fa
- 文件格式：FA
- 字段映射介绍：存储不同编号（b160、b120、b80、B70）的单倍型序列数据，用于分析S位点受体激酶（SRK）等位基因等遗传信息
数据来源
论文“What causes mating system shifts in plants? Arabidopsis lyrata as a case study”
适用场景
- 植物交配系统进化研究：分析Arabidopsis lyrata自交不亲和性丧失及向自交转变的遗传机制
- 种群遗传学分析：探究种群瓶颈对自交系统转变的影响，验证S位点单倍型与交配系统的关联
- 分子进化研究：通过单倍型序列数据，研究S位点受体激酶（SRK）等位基因的进化规律
- 进化生物学方法验证：结合经典遗传学与深度测序数据，验证交配系统转变研究的分析方法有效性
