数据集概述
本数据集基于279个伊比利亚半岛拟南芥(Arabidopsis thaliana)地理参考样本,包含核单核苷酸多态性、叶绿体单核苷酸多态性及开花春化需求分析得到的三种种内遗传单元数据,结合气候、植被和土壤数据构建物种分布模型,对比当前及极端气候变化场景下的分布预测结果,用于分析种内遗传单元的生物地理模式及气候变化响应。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_Arabidopsis_data_279accessions_20jan16.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集核心内容,包括环境变量与拟南芥遗传数据的关联信息,以及Excel文件中工作表的结构说明(如环境变量的变量类型、名称及数据列分布)。
- 数据文件
- 文件名称:Arabidopsis_data_279accessions_20jan16.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含4个工作表,其中Sheet 1记录279个样本的11项环境变量数据,字段包括Count(计数)、Accession code(样本编号)、地理、环境、植被及土壤相关变量数据(共11列,对应C-M列)。
数据来源
论文“Tackling intraspecific genetic structure in distribution models better reflects species geographical range”
适用场景
- 种内遗传单元生物地理模式分析: 基于遗传数据与环境变量的关联,解析拟南芥不同遗传单元的分布规律及环境驱动因素。
- 气候变化对物种分布的影响预测: 对比当前与极端气候变化场景下遗传单元的潜在分布变化,评估生物多样性对全球气候变化的响应。
- 物种分布模型优化研究: 验证纳入种内遗传结构的分布模型在预测准确性上的提升效果。
- 植物适应性进化研究: 分析遗传单元的环境适应特征,探究拟南芥开花春化需求等生理性状与地理分布的关联。