数据集概述
本数据集为拟南芥适应性进化研究数据,包含重组自交系(RILs)及亲本在瑞典原生境连续三年的表型数据、基因型数据与数量性状位点(QTL)分析文件。核心内容涉及早期生活史选择的年际变异、全生命周期适合度的遗传基础,以及本地适应机制,共含四个文件,支持多年度全生命周期选择压力与遗传机制的研究。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README_for_RIL_phenotypes_genotypes_QTLanalysis.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:提供数据集的说明文档,涵盖RIL群体表型、基因型及QTL分析的背景、实验设计与数据使用指引
- 数据文件
- 文件名称:RIL_phenotypes_genotypes_QTLanalysis.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含RILs群体的表型数据,涵盖2012-2014年的萌发成功率(estsuc)、成年存活率(adultsurv)、繁殖力(fecund)、适合度(fitness)、萌发时间(germtime)等年度性状数据
- 文件名称:Parents_phenotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录意大利与瑞典两个亲本基因型的表型数据,用于对比分析本地与非本地基因型的适合度差异
- 代码文件
- 文件名称:QTLanalysis.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于对RIL群体表型与基因型数据进行QTL分析的R代码脚本,支持适合度相关性状的遗传位点定位
数据来源
论文“Among-year variation in selection during early life stages and the genetic basis of fitness in Arabidopsis thaliana”
适用场景
- 植物适应性进化研究: 分析拟南芥早期生活史选择的年际变异规律与全生命周期适合度的遗传基础
- 本地适应机制验证: 对比本地(瑞典)与非本地(意大利)亲本基因型的适合度差异,探究本地适应的维持机制
- 数量性状遗传分析: 利用QTL分析脚本定位适合度相关性状的遗传位点,解析适应性性状的遗传架构
- 进化生态学多年度研究: 支持多年度全生命周期选择压力的量化分析,验证年际环境波动对选择方向与强度的影响