数据集概述
本数据集围绕拟南芥意大利与瑞典本地适应种群的耐寒性遗传基础展开,通过QTL定位探究耐寒性对本地适应性及遗传权衡的贡献,涉及7个QTL位点分析,其中5个位点的瑞典基因型提升耐寒性,部分与适应性生存QTL共定位,揭示了CBF2等基因在自然环境适应性权衡中的作用。
文件详解
meangeno.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含基因型数据,字段包括样本ID及多个标记位点(如X1_371484、X1_658928等)的基因型信息
meanpheno.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含表型数据,字段包括QN_Mean_survival(标准化生存均值)、Mean_survival(生存均值)、样本ID
ParentalMeans_SummedLODTests_and_Tradeoffs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含亲本均值、LOD检验结果及适应性权衡相关数据
Map_FrzT_QTL_w_Rqtl_script.Rd
- 文件格式:RD
- 字段映射介绍:使用R/qtl工具进行耐寒性QTL定位的脚本说明文档
数据来源
论文“Data from: QTL mapping of freezing tolerance: links to fitness and adaptive trade-offs”
适用场景
- 植物遗传学研究:分析拟南芥耐寒性的遗传位点及基因型与表型的关联
- 适应性进化研究:探究本地适应种群的耐寒性对环境适应性权衡的影响机制
- 植物抗逆性分子机制研究:验证CBF2等基因在耐寒性及适应性中的功能作用
- 遗传育种应用:为拟南芥耐寒性相关的分子标记辅助育种提供数据支持
- 生态遗传学分析:研究自然环境中植物性状与基因对适应性权衡的介导作用