数据集概述
本数据集围绕亚热带蜘蛛Araneus omnicolor展开,包含其更新世生态位稳定性与谱系分化相关的遗传、地理及模拟数据。涵盖线粒体COI与核ITS2基因序列分析、不同气候情景下的分布模型、种群历史模拟等内容,用于探究第四纪气候振荡对该物种生态位及遗传模式的影响。
文件详解
- Peres_et_al_geographic_and_haplotypic_information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含地理信息与单倍型数据,记录130个个体的采样分布及基因单倍型特征
- Peres_et_al_EBSP.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:扩展贝叶斯天际线图(EBSP)分析的元数据文件,用于种群动态历史推断
- Peres_et_al_occurrence_records.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:物种出现记录数据,包含现生、末次盛冰期(LGM)、末次间冰期(LIG)等气候情景下的分布点位信息
- Peres_et_al_simulations_ms_python_scripts.rar
- 文件格式:RAR
- 字段映射介绍:压缩包内包含基于ms软件的种群历史模拟Python脚本,用于近似贝叶斯计算(ABC)分析
- Peres_et_al_COI_bayesian_inference.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:线粒体COI基因的贝叶斯系统发育推断元数据文件,记录谱系分化时间校准信息
数据来源
论文“Pleistocene niche stability and lineage diversification in the subtropical spider Araneus omnicolor (Araneidae)”
适用场景
- 古气候对生物谱系分化影响研究:分析第四纪气候振荡下Araneus omnicolor的种群动态与谱系分化模式
- 生态位稳定性评估:基于现生、LGM、LIG气候情景的分布模型,探究物种生态位在更新世的稳定性
- 种群遗传学分析:利用COI与ITS2基因数据,研究物种的单倍型多样性、核苷酸变异及种群结构特征
- 生物多样性保护策略制定:结合物种生态位宽度与环境耐受性,为亚热带无脊椎动物的保护提供科学依据
- 近似贝叶斯计算方法应用:通过模拟脚本与观测数据的对比,验证种群历史假说(如泛交种群模型)的合理性