数据集概述
本数据集为古菌基因组核心通路编码序列解构分析结果，包含71种古菌（覆盖不同分类类群与生理类型）的基因组数据及5条核心通路的编码序列分析文件，涉及密码子使用模式、密码子对偏好等研究内容，可用于探究古菌核心通路编码序列的组装策略与共识特征。
文件详解
- 压缩文件（Archive files）
- 文件名称：All 71 genomes 5 pathways.rar
- 文件格式：RAR
- 内容说明：包含71种古菌基因组数据及5条核心通路相关序列的压缩文件
- 文件名称：All 71 Whole Genomes.rar
- 文件格式：RAR
- 内容说明：包含71种古菌全基因组数据的压缩文件
- 数据文件（Data files）
- 文件名称：codon pair ratio.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：记录古菌基因组及核心通路基因的密码子对使用比例数据
- 文件名称：Codon Count.xls
- 文件格式：XLS
- 内容说明：统计古菌基因组及核心通路基因的密码子使用数量数据
数据来源
论文“Deconstruction of archaeal genome depict strategic consensus in core pathways coding sequence assembly”
适用场景
- 古菌基因组学研究: 分析71种古菌的基因组结构与核心通路编码序列特征
- 密码子使用模式分析: 基于密码子数量与密码子对比例数据，探究古菌核心通路的密码子偏好性
- 核心通路进化研究: 比较不同生理类型（需氧/厌氧）古菌核心通路的编码序列组装策略差异
- 基因表达调控分析: 研究密码子偏性对古菌基因表达水平的影响机制
- 分类学相关分析: 基于ORF结构模式的相似性，辅助古菌的分类学研究
