数据集概述
本数据集是论文“The World Asellidae database and phylogeny: a collaborative backbone resource for comparative studies of subterranean life evolution”的补充材料，包含10个文件，涵盖Asellidae系统发育树、COI/16S等基因序列比对数据、DNA序列元数据及体型/栖息地等比较分析数据，为地下生物进化比较研究提供结构化资源。
文件详解
- 系统发育树文件
- 文件名称：SI_Figure_05_Saclier_et_al.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含带节点年龄95%置信区间的世界Asellidae系统发育树，节点标签标注估计日期的可信区间
- 基因序列比对文件（.mase格式）
- 文件名称：SI_Table_05_Saclier_et_al_COI_aln.mase、SI_Table_06_Saclier_et_al_16S_aln.mase、SI_Table_07_Saclier_et_al_FASTKD4_aln.mase、SI_Table_08_Saclier_et_al_28S_aln.mase
- 文件格式：MASE
- 字段映射介绍：分别对应424条COI、16S、FASTKD4、28S基因序列的比对数据，用于四基因定年系统发育分析
- 基因序列比对文件（.fas格式）
- 文件名称：SI_Table_04_Saclier_et_al.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：2093条COI序列的比对数据，用于MOTUs界定
- 元数据与分析数据文件（.xlsx格式）
- 文件名称：SI_Table_01_Saclier_et_al.xlsx、SI_Table_09_Saclier_et_al.xlsx、SI_Table_11_Saclier_et_al.xlsx、SI_Table_12_Saclier_et_al.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含2093条COI序列元数据、四基因定年系统发育用DNA序列元数据、体型/性二态/栖息地等比较分析数据、NCBI deposited DNA序列元数据
数据来源
论文“The World Asellidae database and phylogeny: a collaborative backbone resource for comparative studies of subterranean life evolution”
适用场景
- 地下生物进化研究: 利用系统发育树与基因序列数据，分析Asellidae类群的演化历史与地下适应性
- 生物信息学分析: 通过COI/16S等基因序列比对数据，开展分子系统学与物种界定（MOTUs）研究
- 比较生物学研究: 结合体型、性二态、栖息地数据，探究地下生物性状进化规律
- 生物多样性数据库建设: 作为Asellidae类群数据资源，支持全球地下生物多样性研究与数据整合
