数据集概述
本数据集为地中海蕨类植物进化与杂交起源研究的配套数据，聚焦Asplenium obovatum和A. adiantum-nigrum复合体，包含5个二倍体与4个多倍体类群的系统发育分析结果，涉及36份新样本的叶绿体序列、GenBank公开序列及137种Asplenium属物种的分子定年分析数据，共7个文件。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre格式）
- 文件名称：Fig_4_Testo.MCC.tre、Fig_4_Rothfels.MCC.tre、Fig_3_ML.tre、Fig_3_BI.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：包含基于最大似然法（ML）、贝叶斯推断（BI）及马尔可夫链蒙特卡洛（MCC）方法构建的系统发育树结构，记录物种间的亲缘关系与分支支持度
- 分子定年分析文件（.xml格式）
- 文件名称：Fig_4_TestoDates.xml、Fig_4_RothfelsDates.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：记录Testo与Rothfels两种分析框架下的分子定年结果，包含物种分化时间的估计参数与置信区间
- 序列矩阵文件（.nex格式）
- 文件名称：Asplenium_obovatum.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：包含Asplenium obovatum复合体的序列比对矩阵，为系统发育分析的原始数据基础
数据来源
论文“Evolution and reciprocal origins in Mediterranean ferns: the Asplenium obovatum and A. adiantum-nigrum complexes”
适用场景
- 蕨类植物系统发育研究：用于分析Asplenium属地中海类群的亲缘关系与分类地位
- 植物杂交起源验证：通过多倍体类群的序列聚类结果，探究其亲本来源与杂交事件发生机制
- 分子进化速率分析：利用分子定年数据研究蕨类植物的分化时间与进化速率
- 植物多倍体演化机制研究：分析多倍体类群的多起源性与正反交亲本组合模式
- 生物地理学分析：结合分化时间数据，探讨地中海区域蕨类植物的地理起源与扩散路径
