数据集概述
本数据集包含野生大西洋鲑鱼基因组基因渗入模式研究的相关数据，通过1986个SNPs和17个微卫星标记的全基因组分析，评估1996-2012年波罗的海芬兰湾野生种群受孵化场逃逸个体基因流的遗传影响，涉及基因多样性变化、种群遗传结构及基因组渗入模式异质性等内容，共3个文件。
文件详解
- 基因频率数据文件
- 文件名称：Ozerov_et_al_2016_estimated_SNP_allele_frequencies.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含野生大西洋鲑鱼种群中1986个SNPs标记的等位基因频率估算数据，用于分析基因渗入对种群遗传多样性的影响
- 微卫星基因型数据文件
- 文件名称：Ozerov_et_al_2016_Individual_microsatellite_genotypes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录野生大西洋鲑鱼个体的17个微卫星标记基因型数据，用于评估种群遗传结构及基因渗入程度
- 核平滑与置换检验脚本文件
- 文件名称：Kernel_smoothing&permutation_test_script.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于分析基因组渗入模式异质性的R语言脚本，包含核平滑和置换检验的分析流程，支持检测基因组中非随机渗入区域
数据来源
论文“Data from: Genomewide introgressive hybridization patterns in wild Atlantic salmon influenced by inadvertent gene flow from hatchery releases”
适用场景
- 水产养殖遗传影响研究: 分析孵化场逃逸个体对野生大西洋鲑鱼种群的基因渗入程度及遗传同质化风险
- 基因组渗入模式分析: 探究野生大西洋鲑鱼基因组中基因渗入的异质性分布及非随机渗入区域特征
- 种群遗传多样性评估: 利用SNPs等位基因频率数据评估基因渗入对野生种群遗传多样性的影响
- 遗传结构动态变化研究: 通过微卫星基因型数据追踪1996-2012年野生大西洋鲑鱼种群遗传结构的时间变化趋势
- 基因组选择与重组分析: 结合核平滑与置换检验结果，研究选择、重组及随机过程对基因渗入模式的作用机制
