数据集概述
本数据集为切叶蚁Atta cephalotes脑转录组研究的补充数据，聚焦不同形态、行为和神经解剖特征的工蚁群体脑基因表达差异。约50%差异表达基因与体型相关，同时存在不受形态影响的脑基因表达差异，部分与神经纤维网缩放模式相关，涉及核酸调控、代谢等功能，支撑脑基因表达与社会角色的关联。
文件详解
- 转录组序列文件
- 文件名称：A_cephalotes_whole_brain_all_samples_merged.fa
- 文件格式：FA
- 字段映射介绍：包含所有样本合并的全脑转录组序列信息
- 基因列表文件
- 文件名称：Supplementary_Table_2-All_genes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录研究涉及的所有基因基础信息
- 差异表达基因文件（无冗余）
- 文件名称：Supplementary_Table_3-All_DEGs_without_redundancies.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含去冗余后的所有差异表达基因ID信息
- 两两比较差异表达基因文件（样本组）
- 文件名称：Supplementary_Table_4-All_DEGs_for_each_pairwise_comparison.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录不同工蚁体型组两两比较的差异表达基因，含baseMean、log2FoldChange等统计量
- 两两比较差异表达基因文件（蚁群组）
- 文件名称：All_colony_DEGs_for_each_pairwise_comparison.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录不同蚁群工蚁两两比较的差异表达基因相关统计信息
- cDNA计数文件
- 文件名称：cDNA_counts.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含cDNA序列的计数数据
- 说明文档
- 文件名称：READ_ME_Transcriptomics_of_mosaic_brain_differentiation_underlying_complex_division_of_labor_in_a_social_insect.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集的总体说明信息，生成于2022-08-05
数据来源
论文“Transcriptomics of mosaic brain differentiation underlying complex division of labor in a social insect”
适用场景
- 社会昆虫脑进化研究: 分析切叶蚁不同分工工蚁脑基因表达与神经解剖分化的关联
- 基因表达与体型关联分析: 探究体型对脑差异表达基因的影响机制
- 神经行为学机制研究: 结合基因本体论富集结果，解析社会角色相关的神经调控通路
- 转录组数据整合分析: 利用多类型文件开展基因表达模式与社会分工的交叉验证
