数据集概述
本数据集包含Austropuccinia psidii效应子候选的原始及补充数据，涉及效应子的序列比对、实验数据记录等内容，共32个文件，涵盖多种文件格式，为研究该病原菌的效应子功能提供数据支持。
文件详解
- 序列比对文件
- 文件名称：如EFC1-17_mapped_all_nomismatch_notrim.fasta、5292_Alignment.fasta、1260_Alignment.fa等
- 文件格式：.fasta、.fa
- 字段映射介绍：包含效应子候选的序列比对结果，记录相关核苷酸或氨基酸序列信息
- 序列比对索引文件
- 文件名称：如EFC1-31_mapped_all_nomismatch_notrim.bam、EFC1-01_mapped_all_nomismatch_notrim.bam等
- 文件格式：.bam
- 字段映射介绍：与.fasta序列文件对应的二进制比对索引文件，用于高效存储和检索序列比对数据
- 实验数据文件
- 文件名称：EFC1_coinoculation.xlsx、effector_invitro.xlsx、effector_detachedleaf.xlsx等
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：包含效应子相关的实验数据记录，如共接种实验、离体实验、 detached leaf实验等数据
适用场景
- 植物病原菌效应子功能研究: 分析Austropuccinia psidii效应子候选的序列特征及潜在功能
- 生物信息学序列比对分析: 利用.fasta和.bam文件开展效应子序列比对、基因注释等生物信息学分析
- 植物病理学实验数据验证: 结合.xlsx实验数据，验证效应子对寄主植物的致病作用机制
- 植物病害防控研究: 基于效应子候选数据，开发针对Austropuccinia psidii的病害防控策略
