数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了AX1745品系npr-5(ok1583)V基因突变线虫的行为实验数据。实验由William R Schafer实验室开展,包含线虫在NGM培养基上的行为视频及分析结果,涉及基因、品系、实验条件、行为特征等核心信息,可用于研究npr-5基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:npr-5 (ok1358) on food L_2010_01_28__11_56_3746.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为相关的wcon格式数据压缩包
- 特征数据文件
- 文件名称:npr-5 (ok1358) on food L_2010_01_28__11_56_3746_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,由tierpsy软件分析生成
- 实验数据文件
- 文件名称:npr-5 (ok1358) on food L_2010_01_28__11_56_3746.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始数据及处理结果,涉及线虫行为的时间、帧速率、像素与微米映射、分段骨架数量等参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析npr-5基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 分子生物学实验验证:验证AX1745品系npr-5(ok1583)V突变体的行为表型特征
- 线虫行为学分析:研究秀丽隐杆线虫在特定培养基(NGM agar low peptone)上的运动行为规律
- 实验方法参考:参考E. Yemini等提出的线虫行为实验方法及tierpsy软件的数据分析流程