数据集概述
本数据集为红头潜鸭(Aythya ferina)全范围遗传种群结构研究数据,包含线粒体控制区部分序列和多位点微卫星基因型数据,样本来自欧亚大陆繁殖地和越冬地,含部分H5N1阳性个体。数据用于分析种群遗传分化、迁徙习性及作为禽流感病毒传播媒介的潜力,共2个文件。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_EE-Aythya ferina.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供数据集的背景说明、样本来源、实验方法及数据使用说明等辅助信息
- 压缩数据包
- 文件名称:EE-Aythya ferina.zip
- 文件格式:ZIP
- 包含文件:Microsatellite data Aythya ferina_genotype_table_with co.xlsx(微卫星基因型表)
- 字段映射介绍:
- 第1列:Sample ID(样本编号)
- 第2列:Sampling locality(采样地点)
- 第3-4列:locus CAUD13(位点CAUD13的等位基因大小)
- 第5-6列:locus Smo11(位点Smo11的等位基因大小)
- 第7-8列:locus Sfiu04(位点Sfiu04的等位基因大小)
- 第9-10列:locus MM05(位点MM05的等位基因大小)
- 第11-12列:locus CMMAAT28(位点CMMAAT28的等位基因大小)
- 第13-14列:locus Apl12(位点Apl12的等位基因大小)
- 第15-16列:locus CMMAAT38(位点CMMAAT38的等位基因大小)
- 后续列:其他微卫星位点的等位基因大小数据
数据来源
论文“Range-wide genetic population structure of common pochard (Aythya ferina): a potentially important vector of highly pathogenic avian influenza viruses”
适用场景
- 动物种群遗传学研究:分析红头潜鸭繁殖种群的遗传分化程度及母系遗传(mtDNA)与核基因(微卫星)的差异
- 禽流感病毒传播机制研究:结合种群遗传结构与迁徙习性,评估红头潜鸭作为H5N1等病毒传播媒介的潜力
- 野生动物迁徙生态学分析:通过越冬地种群混合程度,推断红头潜鸭的繁殖地忠诚度及迁徙模式
- 疾病防控策略制定:识别越冬地作为疾病传播热点的可能性,为禽流感防控提供科学依据